Sudoku vam bo omogočil hitro zapiranje praznih mest na genetskih zemljevidih.

Sudoku, igra posnemanja, pica, robotski sortirnik in transpozoni - pravi načini znanosti so neverjetnejši od vseh predstavljivih in nepredstavljivih izmišljij. Po teh poteh biologi zanje ustvarjajo genetske zemljevide in legende ter razumejo, za kaj je vsak gen odgovoren.

Raziskovalci na Princetonu in Harvardu so ugotovili, kako ustvariti orodje za hitrejše in cenejše ugotavljanje delovanja genov. Poročilo o delu se je pojavilo v znanstveni reviji Nature Communications.

Zakaj so geni izločeni?

"Nimamo pojma, kaj počnejo precej velike skupine genov," priznava Baz Barstow, soavtor prispevka in raziskovalni sodelavec Burroughs-Wellcome na oddelku za kemijo na univerzi Princeton. Tudi če je genom organizma dešifriran in prebran, to ne pomeni, da v njem ni več nobenih skrivnosti. Lahko ugotovite, kje se gen nahaja, si predstavljate, katero beljakovino kodira, vendar je le z izračuni skoraj nemogoče razumeti, kaj ta beljakovina počne v telesu.

Kako jim to uspe? Če želite odgovoriti na to vprašanje, si predstavljajte situacijo: v eni sobi vidite neskončne vrste stikal, v drugi sobi pa je prižganih ogromno žarnic. Žice so skrite v steni. Najboljši način, da ugotovite, na katero žarnico je priključeno stikalo, je, da ga izklopite in vidite, katera ugasne. Enako se naredi z geni. Žarnice so fenotipske lastnosti, ki jih opazimo v organizmu, stikala za luči pa so genom. Da bi razumeli, za kaj je gen odgovoren, je najlažje, da ga "izklopite" in pogledate rezultat. V angleščini se to namerno blokiranje gena imenuje "knocking-out", to je "knockout".

Toda odkrivanje funkcij velikega števila genov zahteva ogromno časa in denarja - leta in milijone dolarjev. Zaradi tega genetski zemljevidi s popolnoma dešifriranimi funkcijami vsakega gena obstajajo le za majhno število dobro raziskanih modelnih organizmov, kot so pekovski kvas ali bakterije. Escherichia coli(Escherichia coli), čeprav je ogromna vsebina informacij in uporabnost takšnih izločenih zbirk nedvomna. Od njihove objave je do njih dostopalo na tisoče raziskovalnih skupin.

Tudi pica ni pomagala

Znanstveniki z univerz Princeton in Harvard so našli način, kako hitro in enostavno ugotoviti delovanje posameznega gena. Zdaj bo trajalo le nekaj tisoč dolarjev, celoten postopek pa bo trajal manj kot mesec dni. Nova tehnologija se imenuje "knockout sudoku" v čast istoimenske uganke.

Ta tehnika temelji na naključnem izločitvi genov in zmogljivem algoritmu, ki pomaga "zapolniti manjkajoče celice" v genomski uganki. Nobena od raziskovalnih skupin, ki so že poskusile enak pristop, se ni približala ceni in hitrosti, ki ju bo Knockout Sudoku prinesel znanstveni skupnosti. »Upamo, da bo genetika končno presegla študijo modelnih organizmov,« pravi Michael Baum, soavtor prispevka s Harvardske medicinske šole.

Knockout Sudoku shema

Raziskava se je začela z ogromnim kupom računov za pico in transpozonsko mutagenezo. Ta metoda vam omogoča, da vstavite eno zaporedje DNK v naključni gen in blokirate njegovo delovanje. Vendar to zahteva veliko mutantnih kopij, da se zagotovi, da je vsak gen izklopljen v vsaj eni od njih. Znanstveniki so začeli s kolonijo 40.000 bakterij Shewanella oneidensis, ki ima približno 3600 genov. Da bi ročno razvrstil mutante in jih naselil v različne luknje, je Barstow najel študente, katerih delo je obljubil plačati s pico. Po celodnevnem delu so bili rezultati porazni: razvrščenih je bilo le nekaj tisoč bakterij.

Posledično je bilo odločeno, da se najame sortirni robot. V samo dveh dneh je vse mutante razdelil v 417 posameznih vdolbinic na ploščah s 96 vdolbinicami. Toda pravi preizkus je bilo prebrati genome vseh mutantnih variant, da bi jih lahko našteli in identificirali funkcijo vsakega izločenega gena. Da bi to naredili, se DNK vsake mutirane različice običajno pomnoži (»pomnoži«) in nato sekvencira (odčita njeno zaporedje). Genetika je predlagala poenostavitev tega zapletenega in dolgotrajnega dela dela z združevanjem različnih mutantov na poseben način, zaradi česar ni bilo treba prebrati 417 genomov, temveč 61, kar je skoraj 7-krat manj.

"Večcelične" uganke so testirali na enoceličnih genomih

Toda tudi rezultate tega celotnega dolgega procesa prejmejo znanstveniki v obliki ogromnega kupa podatkov, ki jih je treba obdelati, da bi razumeli, iz katerih mutantov so bila pridobljena zaporedja (beri genomska zaporedja). Da bi se spopadli s to težavo, so raziskovalci ustvarili algoritem, ki bi lahko, tako kot oseba, ki rešuje sudoku, prepoznal tablico, stolpec in vrstico luknje, iz katere je prišla mutirana različica. Bila je še ena težava. Ker je mutacije povzročil transpozon, ki se je spontano vstavil v genom, so se lahko naključno ponovile. Da bi našel rešitev, si je Barstow celo ogledal The Imitation Game, film o Alanu Turingu, ki razbija kodo za nemški šifrirni stroj Enigma. Po njegovem mnenju je bilo delo resnično podobno razbijanju kode. »Na primer, v angleščini se črka »a« uporablja s frekvenco 8,2 %. Če torej naletite na neznano črko, ki se pojavi s frekvenco 8,2 %, lahko domnevate, da je črka, ki jo iščete, "a." Ta preprost statistični sklep, imenovan tudi Bayesian (v čast angleškemu matematiku in duhovniku Thomasu Bayesu iz 18. stoletja), je postal ključ do rešitve "izločilnega sudokuja".

Avtorji dela poudarjajo, da matematične metode, na katerih temelji tehnologija, omogočajo pridobitev veliko več rezultatov z manj poskusi. Ta metoda jim je pomagala razumeti delovanje bakterijskih genov. Shewanella oneidensis, ki so znani po svoji sposobnosti prenosa elektronov, so potencialni viri električne energije, ki ne škodujejo naravi in ​​jih je mogoče uporabiti pri umetni fotosintezi (o čemer si lahko več preberete na spletnem mestu z ocenami: in) in za nevtralizacijo jedrskih odpadkov. Če bi uporabili stare metode, bi to zahtevalo približno 15 let raziskav.

Natančnost rezultatov je bila sprva precej nizka. Potem ko so ponovno preverili matematične izračune in tam niso našli nobenih napak, so se znanstveniki obrnili na plošče in jamice. Izkazalo se je, da je bila težava v tem, da je eden od pomočnikov tja postavil en napačen vzorec. Raziskovalci so si oddahnili: najbolj nezanesljiv del njihove tehnologije so se izkazali ljudje.

“Gensko spremenjeni izdelki” - “Da” - 26 oseb “Ne” - 24 oseb “Težko odgovorim” - 1 oseba. Hipoteze. V anketi je sodelovalo 130 ANKETIRANCEV/študentov 1., 2., 3. in 4. letnikov. "Da" - 44 oseb "Ne" - 5 oseb "Včasih" - 2 osebi. B-12 Djakova Nadežda. Delo je izvajala študentka gr. Metode: Ali uporabljate GSO izdelke?

“Genska interakcija” - Razcepitev fenotipa v F2 3:1. Slovar. Dedovanje pod nepopolno prevlado. R. Popolna prevlada. Sodelovanje. Pripravljeno: Art. 18 skupin 1. letnika medicinske fakultete. Gene. H.J.B. Epistaza. G. III skupina. Interakcija genov.

"Transgeni organizmi" - Kaj jemo? Paradižnik z genom iverke. Čigavi izdelki vsebujejo transgene komponente. Genski inženiring. Pasma prašičev z genom za "rast". Kako nastanejo GSO? Genetika se je naučila izdelovati himere. Transgene živali. JESTI ALI NE JESTI? - to je vprašanje. GSO: za ali proti? GMP je veliko in obetavno podjetje. Transgene koze proizvajajo edinstveno mleko, ki nadomešča človeško materino mleko.

"Prevod" - Model hibridnih stanj. Iniciacijski faktorji, povezani z majhno ribosomsko podenoto (prokarioti). Regulacija prevajanja: izvoz mRNA iz jedra v citoplazmo. Razgradnja mRNA z endonukleazami. Programiran premik bralnega okvirja. Trans-oddaja. Regulacija prevoda: ribo stikala. Sekundarna struktura rRNA (1).

"GSO" - In v naravi obstajajo organizmi, ki niso primerni za prehrano ljudi (strupeni in mutageni). Predstavitev na temo Gensko spremenjeni organizem (GSO). Kako razlikovati gensko spremenjene izdelke? Varnost GSO. Delo na ustvarjanju GSO se mora nadaljevati. Ustvarjalci GSO. Uporaba GSO. Vsebina. Stališče Greenpeacea.

"Odkritja v genetiki" - 1935 -N. Sodobna genetika Transgeni organizmi. O. Avery. Odkritje zakonov dednosti. Razvoj kromosomske teorije. Preteklost genetike. A. Hershey. Kloniranje. John Gurdon je angleški mikrobiolog, ki je bil začetnik kloniranja. Dekodiranje strukture molekule DNA. Leta 1953 sta angleški biofizik in genetik F. Crick in ameriški biokemik J.

Skupaj je 16 predstavitev

Alkimija-Genetika - Igra na Androidu, s pomočjo katerega boste križali različne živali in sčasoma dobili nove vrste. Izberite živali in jih pritrdite na zaslon za hiter ogled različnih kombinacij. In lahko jih je veliko, do 450 novih vrst, od očitnih do neverjetnih. ruski jezik: da Podpira namestitev na zunanjo kartico SD: ne. Prenesite Alchemy Alkimija za Android brezplačno. Posebnosti igre: Animirane figure čarobnih bitij Namigi za začetnike Podroben tečaj usposabljanja Več načinov igre Jasen vmesnik Možnost spreminjanja kota kamere Sistemske zahteve: OS: Windows XP Procesor: Intel Pentium® III 800 MHz RAM: 128 MB Prosti prostor na trdem disku: 100 MB Leto izdelave: 2008 Jezik: Ruska medicina: ni potrebno Velikost: 49,79 MB. GameXworld.net - Prenos igre prost " igra alkimija genetika nasveti.

Igrajte igre Parkiranje na spletu

Android igre» Uganke » Alkimija~Genetika. Jezik igre: angleščina. Datum objave: 13. december 2013 Zanimivi izbori - Igre, zabava in programi - Igra - alkemijska igra genetika odgovori. Cona 51 ( angleščina. Območje 51) - Ameriško vojaško letališče, izbrisano s krizo 2 - Igra leta. Crysis 2 (izgovorjeno [?kr??s?s tu?]) - računalnik Igra, Poker kartica Igra.

Spletne igre s popolno pikantnostjo

Alkimija Genetska alkimija~genetika. Igra serija Alkimija, kjer morate povezati različne Alkimija-Genetika- zabavna logična uganka, ki od igralca zahteva, da križa različne živali. nasvet in nasveti.. Močan zdravilni eliksir, na voljo na 7. ravni spretnosti alkimija, .. Za razliko od drugih rastlin je prepovedani sadež mogoče ustvariti le z genetskim poskusom v znanstveni ustanovi. odgovori Igre Alkemija-Genetika. Pomen igre kot je piščanec + slon [VELIKAN] = noj (velikanski piščanec). To je vse, če ste preleni, da brskate po zapiskih, lahko vprašate v razpravi. odgovori Igre Alkemija-Genetika. galeb + tiranozaver = galeb. ruski jezik. Opis igre Alkimija Genetika (Alkemijska genetika): ti si nor genetik in na voljo vam je cel laboratorij, opremljen z vsem, kar je mogoče za izvajanje različnih poskusov. Vaša naloga bo križati različne vrste živali, ptic in rib, da bi vzgojili nove vrste. angleški jezik za otroke in odrasle. Mesec treningov brezplačno!

Kot vemo, alkimija kot znanost že dolgo ni dobra. Toda kot zabavna dejavnost, ki vam omogoča, da vadite logiko in se preprosto zabavate, je alkimija tako ljubljena kot spoštovana. Sicer pa, od kod toliko priljubljenih iger s tem naslovom v Google Play? Če pa vam običajno tovrstne igre ponujajo, da pričarate z neživimi predmeti, Alkimija-Genetika ponudi, da preizkusite haljo norega znanstvenika, ki iz dobrote svojega srca križa različna bitja in tako dobi ... Kaj pa boste dobili - videli boste sami.

Razvijalec takoj opozarja: igra je izključno za tiste, ki imajo dober smisel za humor. Tako kot recepti za zgodovinsko alkimijo so tudi predlagana dejanja popolnoma neznanstvena in ne izobraževalna. Kot v kateri koli igri Alchemy se bitja križa tako, da jih preprosto povlečete eno čez drugo. Ne glede na to, kako kontraintuitivne se zdijo številne kombinacije, je v teh kombinacijah vedno nekaj zdravega razuma. Vsako bitje, pa naj bo prava žival ali bajeslovno bitje, ima tvoja lastnost, tvoj "gen", ki na koncu poskrbi za želeno preobrazbo.

Razvijalec svojo idejo ponazori takole:

  • Mravlja (žuželka) v kombinaciji s podgano ("repi" gen) daje rezultat Škorpijon- repasti (podgana) členonožci (mravlje)
  • Inčuni (ribe) v kombinaciji s piščancem ("domači" gen) dajo zlata ribica- domače (piščančje) ribe (inčuni)

Torej vam ni treba vedno razmišljati o tem, kaj se lahko izcimi iz zakonske zveze med dvema različnima živalima - raje morate vzeti samo eno od njunih lastnosti, kar bo pri nekaterih logičnih konstrukcijah povzročilo nekaj nepričakovanega, pri drugih pa povsem naravnega. Težko si je predstavljati potomca kokoši in ribe, sploh pa si ni težko predstavljati, kako izgleda domača riba.

Za najbolj natančne igralce ponujam izbor 113 receptov v igro Alchemy-Genetics različnih igralcev. Kombinacije, ki so se jim zdele najtežje, sem uredila v seznam in vse shranila v PDF format. Samo igro in recepte zanjo lahko prenesete s povezavami pod tem člankom. Polovico receptov, ki sem jih zbral, pustim pod spojlerjem. Ta seznam je bolj priročno uporabiti v celotni datoteki - tam lahko poiščete bitje, ki ga želite dobiti (ali kombinacije, ki vas zanimajo), in takoj poiščete recept ali se prepričate, da manjka. Točno tako priporočam uporabo.

  • Mravlja+ščuka=ognjena mravlja
  • Metulj + slon = navadni jezik
  • Modra žaba + človek=NAVI
  • Orel+človek=Ra
  • Škrat+veverica=Hobit
  • Piščanec+zlati krap=golob
  • Piranha+kača=morski pes
  • Šakal+morski prašiček=pes
  • Android + človek = wallie
  • Človek + tujec = morska morska deklica
  • Kojot + človek = anubis
  • Pes + ognjena mravlja = volk
  • Pes + volk = pes dingo
  • Rakun + tiger = obročasti lemur
  • Hobotnica + škorpijon = hobotnica z modrimi obročki
  • Volk + kenguru = tilacin
  • Duh + piraja = dementor.
  • Mravlja + podgana = škorpijon
  • Sardel + piščanec = zlata ribica
  • Tjulenj+kokoš=pingvin
  • Varan kuščar + povodni konj = krokodil
  • Legvan + muha = varan
  • Mravlja + kača = pajek
  • Mačka+kameleon=češirska mačka
  • Orel + noj = sokol
  • Rak+grif=naglavni rak
  • Rak+hornbird=glavni rak
  • Orel+rogovec=grif
  • Konj+hornbird=Los
  • Varan + delfin = krokodil
  • Jelen + kamela = žirafa
  • Hrček+podgana=Hrček podgana
  • Golob + veverica = Do-do
  • Piranha + do-do = morski pes.
  • Rak + kača = morska kumara
  • Kača+rogata ptica=Rogata kača
  • Podgana+kača+pasyuk
  • Kača+cesarski škorpijon=udav
  • Kača+raca=jegulja
  • Kača+kozica=murena
  • Kača+čebela=koralna kača
  • Kača+zajec=kuščar
  • Kača+lev=tatzelwurm
  • Kača+Guppy=Brahmanov slepi orel
  • Črv+goljat tarantela=kača
  • Opica + mravlja = človek
  • Obročasti lemur + leteča veverica = opica
  • Veverica + Leteča riba = Leteča veverica
  • Krokar+golob=papiga
  • Golobica+papiga=pigasta golobica
  • Raca+golob=labod
  • Golob+prašič=Do-Do
  • Golob+rakun=Jakobinci
  • Golob+Grif=angel
  • Mačka+povodni konj=ris
  • Mačka+mangrova mravljica=garfield
  • Mačka+tesnilo=ročno
  • Tjulenj+mačka=delfin


Vam je bil članek všeč? Delite s prijatelji!